Tai baþnyèia stovinti Merkinës miestelyje, netoli jo centro. Gotikinë, po rekonstrukcijos ágavusi baroko bruoþø. Manoma, kad pirmoji baþnyèia pastatyta ið tvirtovës iki 1387 m. Baþnyèia Merkinëje minima 1392 m., 1496 m. atnaujinta. 1442 m. Ldk Kazimieras baþnyèiai skyrë turtø. Kiti valdovai juos papildë 1516 ir 1582 m.

1607 m. ásteigtas dominikonø vienuolynas (fundatorius burmistras Kristupas Steponis), 1615 m. pastatyta mûrinë baþnyèia. 1676 m. ásteigtas jëzuitø vienuolynas, pastatyta baþnyèia (hetmono Mykolo Paco rûpesèiu). 1648 m. ið dalies permûrytos ir nutinkuotos parapinës baþnyèios sienos, pastatytas frontonas, ið naujo suskliausti skliautai. 1655 m. baþnyèia apgriauta, iki 1674 m. suremontuota.

Merkinës parapijai 1744 m. priklausë 66 kaimai abipus Nemuno. 1725–1773 m. veikë nepilnoji jëzuitø kolegija; 1774 m. ji atiteko dominikonams, kurie 1776 m. ásteigë mokyklà (veikë iki 1831 m. kaip apygardëlës mokykla). 1822 m. liepos 16 d. per miestelio gaisrà sudegë klebonija ir visos 3 katalikø baþnyèios (parapinë, dominikonø, jëzuitø). 1832 m. uþdaryto dominikonø vienuolyno baþnyèia perduota parapijai, vienuolyne ásikûrë policija ir pasienio sargyba. 1843 m. kunigas Kajetonas Aleknavièius savo lëðomis pastatë klebonijà (su parapijieèiais kalbëjo lietuviðkai), 1856 m. baþnyèia ðiek tiek perstatyta.

1884 m. pagal M. Strebeikos projektà pastatytas priebaþnytis. Konstantinas Jagminas, Merkinëje vikaravæs 1890–1896 m., baþnyèioje pradëjo giedoti lietuviðkai, organizavo lietuviðkø knygø gabenimà ið Tilþës. Kazimiero Ribikausko, Merkinëje klebonavusio 1911–1934 m., rûpesèiu 1912 m. dekoruotas baþnyèios vidus, pastatyta klebonija, atsisakyta lenkiðkø pamaldø. Kiek vëliau vikaras M. Cijûnaitis su vargonininku Sèesnulevièiumi subûrë puikø lietuviðkà chorà. 1912–1914 m. veikë Lietuviø katalikø blaivybës draugijos skyrius, kuriam 1913 m. leista ásteigti bibliotekà - skaityklà.

1913 m. ákurtas „Ryto“ draugijos skyrius. Po Pirmojo pasaulinio karo Merkinëje dirbo kompozitorius Teodoras Brazys ir dr. Juozas Bakðys. Juos ið Vilniaus uþ lietuviðkà veiklà iðtrëmë Vilniaus vyskupijos valdytojas prelatas K. Michalkevièius. T. Brazys Merkinës apylinkëse surinko lietuviðkø dainø, kunigas daktaras J. Bakðys 1921 m. ásteigë progimnazijà ir buvo jos direktorius. Jis, 1924 m. gruodþio 17 d. dviem ðûviais piktadariø suþeistas, 1925 m. sausio 7-àjà mirë.

Po Antrojo pasaulinio karo Merkinëje klebonavo Zigmas Komaras, Sibiro tremtinys, Kaiðiadoryse bolðevikø nuþudytas dekanas Andrius Juknevièius, nuo 1966 m. – Petras Laskauskas (1903–1988), (palaidotas ðventoriuje). Baþnyèia 1930 m., po 1941 m. gaisro ir 1971–1972 m. remontuota.

Baþnyèia gotikinë, po rekonstrukcijos ágavusi baroko bruoþø, bebokðtë, su trisiene apside. Vidus 3 navø, atskirtø kolonomis. Presbiterijà nuo navø skiria 3 triumfo arkos. Ðventoriaus tvora akmenø mûro. Vartai su mûrine varpine (XIX a.).

Vyskupija: Kaiðiadoriø vyskupija.
Dekanatas: Merkinës dekanatas.
Regionas: Dzûkija. Maldos namai Dzûkijoje
Savivaldybë: Varënos rajono savivaldybë. Maldos namai savivaldybëje
Vietovë: Merkinë [3]
Adresas: V.Sladkevièiaus g. 10, Merkinë, LT-65336 Varënos r.
Tel: (310) 57371

  Nuotraukø galerija - baþnyèios nuotraukose